Stage

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Contexte et problématique : 

Contexte et problématique : 

Détection de rupture multivariée et classification de courbes pour l'analyse de cinétique de métabolites

Mots - clés:  séries temporelles multivariées ; clustering ; détection de rupture ; métabolomique

Contexte

The Ekinocs team at In

Ce stage de 6 mois porte sur la prévision de séries temporelles, avec un accent sur l’explicabilité des méthodes utilisées. Un intérêt particulier est porté à la détection des phénomènes atypiques et la quantification de leur impact sur la série temporelle cible. Le candidat idéal est en M2 ou en dernière année d’école d’ingénieur, avec des solides compétences en apprentissage automatique, statistiques et programmation. Une sensibilité aux sciences biologiques, agronomiques ou zootechniques est un plus.

Résumé du projet
Le projet MycoMix (INRAE SPE / Graduate School BIOSPHERA) vise à explorer la façon dont les mélanges de
variétés de blé plus ou moins résistantes à Zymoseptoria tritici, champignon responsable de la septoriose,
influencent les communautés fongiques associées à la plante. Il s’agit d’évaluer dans quelle mesure ces
communautés microbiennes peuvent contribuer à la régulation de la maladie. Plus précisément, le projet
vise à comparer la structure et la composition des communautés fongiques entre des couverts

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Afin d’optimiser les traitements dans l’agriculture, et donc de minimiser leur impact, il est
essentiel d’identifier précisément les plantes à cibler. Or, il existe une grande variété de cultures, de
stades de développements, et de conditions, certaines en lien avec le changement climatique. De
plus, les conditions de prise de vue elles-mêmes peuvent être variables selon le type de capteurs,
l’angle de prise de vue, la luminosité, etc.
Le projet de recherche dans lequel s’inscrit ce stage a pour objectif de permettre de comparer des