Atelier HappyR

Cette séance sera l'occasion de se mettre en mode atelier (ie pas de tuto préparé) et de tester différents packages permettant de traiter des données d'abondance multivariées notamment en écologie, comme (liste non exhaustive)
 

- gllvm : Generalized Linear Latent Variable Models

package : https://cran.r-project.org/web/packages/gllvm/index.html
Estimation is performed using either Laplace approximation method or variational approximation method implemented via TMB (Kristensen et al., (2016), <doi:10.18637/jss.v070.i05>). For details see Niku et al. (2019a) <doi:10.1371/journal.pone.0216129> and Niku et al. (2019b) <doi:10.1111/2041-210X.13303>.
 

 

- hmsc : Hierarchical Modelling of Species Communities (HMSC) is a model-based approach for analyzing community ecological data (Ovaskainen et a.2017a).
https://www.helsinki.fi/en/researchgroups/statistical-ecology/software/hmsc
 

Les amateurs de Python peuvent aussi faire des propositions d'outils/méthodes à tester.
 

Venez nombreux