Cette thèse en probabilités et statistiques appliquées à la génétique des populations porte sur
l’impact de l’hybridation sur la composition génétique de populations issues de plusieurs sources.
Nous développerons d’abord des modèles biparentaux structurés de type Wright-Fisher intégrant
reproduction sexuée, recombinaison, migration et sélection. Le premier objectif sera d’analyser le
comportement asymptotique des fréquences alléliques et des proportions d’admixture, ainsi que
leurs limites en grande population, à l’aide d’outils de processus et calcul stochastiques. Nous
étudierons enfin l’inférence de paramètres démographiques à partir de données génétiques, dans
le cadre d’applications en génétique humaine et en biologie de la conservation.
Ce projet s’inscrit pleinement dans les objectifs du PEPR Maths-Vives, en particulier dans
le cadre de l’action transverse Émergence. Par le développement de nouveaux modèles probabilistes
et statistiques pour décrire l’hybridation, la recombinaison et la démographie, il contribue
directement à une meilleure compréhension des dynamiques du vivant à différentes échelles. De
plus, les applications envisagées en génétique humaine et en biologie de la conservation répondent
respectivement aux enjeux des axes Société et Environnement. Le projet s’ancre tout particulièrement
dans l’action transverse Émergence, avec l’ambition de renforcer les liens entre génétique
et dynamique des populations et de développer de nouveaux outils mathématiques.
Type
Sujet
Modélisation probabiliste et inférence statistique pour les populations hybridées
Date de début
Date de fin
Encadrant(s)
Tristan Mary-Huard, Paul Verdu
Equipe(s)
Contrat de recherche
PEPR Maths Vives
Description/Résumé
Ecole doctorale (pour les thèses)
ED574 EDMH
Directeur.trice (pour les thèses)
Camille Coron
Ecole/université (pour les thèses et les stages)
Université Paris-Saclay
Doctorant(e) accueilli(e) physiquement dans le laboratoire
Activé