Thèses et Post-doctorants
2027
FRANCHETERRE Blanche : Interpretable Methods in Unsupervised and Supervised Learning for Multisource ana- lysis of Exposome Data and Prediction of cancer outcomes (Thèse) - EDMH -
Blanche’s thesis deals with variable selection and dimension reduction methods for pan cancer data with multiple outcomes and observed through multiple omics, including exposome data. It is supported by the H2020 project DISCERN and co-supervised with Marc Chadeau-Hyam at Imperial College.
Directeur.trice : Julien Chiquet - Encadrant(s) : Marc Chadeau-Hyam - Equipe(s) : SOLsTIS
VICTOR François : Développement de méthodes d’apprentissage statistique et d’apprentissage par transfert pour la caractérisation du potentiel agro-écologique et le screening des ressources génétiques (Thèse) - EDMH -
François’ thesis focuses on the development of hybrid statistical and deep learning models for domain transfer in plant genetics. It is financed by the CoBreeding project of the PEPR Agroécologie-Numérique and co-supervised with Tristan Mary-Huard, Jean-Benoist Léger adn Alain Charcosset.
Directeur.trice : Julien Chiquet, Tristan Mary-Huard - Encadrant(s) : Jean-Benoist Léger, Alain Charcosset - Equipe(s) : SOLsTIS
2026
ALLYNDREE Joseph : Développement de méthodes de caractérisation du comportement et des interactions sociales des bovins pour l'évaluation de la santé et du bien-être dans le cadre de la transition agro-écologique (Thèse) - VAAME -
Directeur.trice : - Encadrant(s) : Antoine Cornuéjols, Christine Martin - Equipe(s) : EkINocs
BRICOUT Barbara : Imputation models for biodiversity and ecological science (Thèse) - Sorbonne Univeristé -
Directeur.trice : - Encadrant(s) : Sophie Donnet, Stéphane Robin - Equipe(s) : SOLsTIS
COGNOT Caroline : Modélisation stochastique multisites de séries temporelles de variables météorologiques (Thèse) - EDMH -
Directeur.trice : - Encadrant(s) : Liliane Bel - Equipe(s) : SOLsTIS
HERSERANT Tanguy : Métriques pour le résumé automatique (Thèse) - STIC -
Directeur.trice : - Encadrant(s) : Vincent Guigue - Equipe(s) : EkINocs
RENAULT Aurélien : Prise de décision précoce en environnement non stationnaire (Thèse) - STIC -
Directeur.trice : - Encadrant(s) : Antoine Cornuejols - Equipe(s) : EkINocs
TOUS Jeanne : Détection des changements de structures de groupes au sein de réseaux d'association d'espèces en fonction de l'évolution des paramètres environnementaux, et évaluation des causes de ces changements (Thèse) - EDMH -
Directeur.trice : Julien CHIQUET - Encadrant(s) : - Equipe(s) : SOLsTIS
XIE Sihan : DeepSelectGene: Apprentissage profond à partir de données de génotypes et application à la sélection génomique (Thèse) - ABIES -
Sihan’s thesis focuses on deep learning generative models applied to genotyping data in animal genetics. His thesis supervisor is Eric Barrey, at INRAE’s Animal Genetics department, and the thesis is co-supervised by Blaise Hanczar and myself. It is financed 100% by INRAE via the DIGIT-BIO metaprogramme.
Directeur.trice : Eric Barrey - Encadrant(s) : Julien Chiquet, Blaise Hanczar - Equipe(s) : SOLsTIS
2025
LAMOUROUX Jérémy : Etudes de distributions spatiales régionalisées de contaminants atmosphériques bioacumulées par des mousses végétales (Thèse) - EDMH -
Directeur.trice : - Encadrant(s) : Isabelle ALBERT - Equipe(s) : SOLsTIS