DOUSSON LYS Gaspard : Modélisation probabiliste et inférence statistique pour les populations hybridées (Thèse) - ED574 EDMH -
Cette thèse en probabilités et statistiques appliquées à la génétique des populations porte sur
l’impact de l’hybridation sur la composition génétique de populations issues de plusieurs sources.
Nous développerons d’abord des modèles biparentaux structurés de type Wright-Fisher intégrant
reproduction sexuée, recombinaison, migration et sélection. Le premier objectif sera d’analyser le
comportement asymptotique des fréquences alléliques et des proportions d’admixture, ainsi que
leurs limites en grande population, à l’aide d’outils de processus et calcul stochastiques. Nous
étudierons enfin l’inférence de paramètres démographiques à partir de données génétiques, dans
le cadre d’applications en génétique humaine et en biologie de la conservation.
Ce projet s’inscrit pleinement dans les objectifs du PEPR Maths-Vives, en particulier dans
le cadre de l’action transverse Émergence. Par le développement de nouveaux modèles probabilistes
et statistiques pour décrire l’hybridation, la recombinaison et la démographie, il contribue
directement à une meilleure compréhension des dynamiques du vivant à différentes échelles. De
plus, les applications envisagées en génétique humaine et en biologie de la conservation répondent
respectivement aux enjeux des axes Société et Environnement. Le projet s’ancre tout particulièrement
dans l’action transverse Émergence, avec l’ambition de renforcer les liens entre génétique
et dynamique des populations et de développer de nouveaux outils mathématiques.
Directeur.trice : Camille Coron - Encadrant(s) : Tristan Mary-Huard, Paul Verdu - Equipe(s) : SOLsTIS
FAVROT Armand : Prédiction des émissions d'ammoniac générées par les fertilisants organiques (Thèse) - ABIES -
Directeur.trice : David Makowski - Encadrant(s) : - Equipe(s) : SOLsTIS
HERSERANT Tanguy : Nouvelles métriques pour le résumé automatique (Thèse) - STIC (B) -
Directeur.trice : Vincent GUIGUE - Encadrant(s) : - Equipe(s) : EkINocs
Ibrahim Seydi : Hybrid Models for seismic hazard quantification (Thèse) - EDMH -
Directeur.trice : Sophie Donnet - Encadrant(s) : Merlin Keller, Julien Stoehr - Equipe(s) : SOLsTIS
LORET Alexandre : Méthodes efficaces pour l'estimation de modèles spatio-temporels (Thèse) - ED621 ISMME -
Directeur.trice : ROMARY Thomas - Encadrant(s) : CLAROTTO Lucia, DESASSIS Nicolas - Equipe(s) : SOLsTIS
PICHON Benoit : Modéliser la dynamique d’écosystèmes complexes pour mieux comprendre leur résilience (Thèse) - ED584 GAIA (Montpellier) -
Cette thèse vise à contribuer à la compréhension de la façon dont les écosystèmes arides répondent à des perturbations (aridité et pâturage). Pour ce faire, des modèles mathématiques d'écosystèmes arides dans lesquels la diversité des interactions et des traits fonctionnels, ainsi qu'une pression d'herbivorie explicite seront développés et analysés. De plus, nous nous intéresserons aux changements de structure des réseaux de co-occurrences spatiales de plantes le long de gradients d’aridité et de pâturage. Ces réseaux et modèles permettrons d'identifier les mécanismes (e.g. structure du réseau d’interaction entre espèces) qui permettent l’émergence de réponses abruptes au sein des écosystèmes arides. De plus, la mesure des patrons spatiaux de traits et d'espèce des modèles spatialisés permettrons de développer des indicateurs multi-espèces de résilience des écosystèmes.
Directeur.trice : Sonia Kefi, Sophie Donnet - Encadrant(s) : - Equipe(s) : SOLsTIS
TAHIRI Ouadya : Evaluation des systèmes d'agroforestrie à l'échelle mondiale (Thèse) - ABIES -
Directeur.trice : David Makowski - Encadrant(s) : - Equipe(s) : SOLsTIS